Историческая генетика

Портал о молекулярной диагностике PCR News со ссылкой на рецензируемый научный журнал Cell опубликовал материал Надежды Маркиной «Генетическая история Балкан – от Римской империи до славян».

Международная команда ученых из Испании, Сербии, Канады и США реконструировала генетическую историю Балканского полуострова за два последних тысячелетия. В ходе работы были проанализированы 146 останков из 20 различных мест. Более трети балканских образцов происходили из древнеримского лагеря Виминациум, находившегося на территории нынешней  в Сербии на Дунае, в 12 км от города Пожаревац; основан лагерь в I веке н.э.

Анализ образцов раннего периода (1-250 года н.э.) показал, что почти половина индивидов является прямыми потомками населения …

В составе вегетативной нервной системы, регулирующей деятельность человеческого организма, имеются ноцицепторные (болевые) нейроны, которые активируются болевым раздражителем. А в таких нейронах есть канал ионов натрия Nav1.7, который регулирует возбудимость в них нервного импульса. Канал Nav1.7 кодируется геном SCN9A. Мутации в этом гене могут вызывать либо нечувствительность к боли, либо, напротив, повышенную болевую чувствительность.

В 2020 году стало известно, что замена в канале Nav1.7 in vitro (вне организма, «в пробирке») трёх аминокислот (мутации M932L, V991L и D1908G) влияет на функцию Nav1.7). На основе данных Британского биобанка (UK BB) было обнаружено, что люди с этими мутированными вариантами генов испытывают более сильную боль. …

В ходе эволюции современному человеку наряду с полезными качествами досталось множество наследственных болезней.

Родина всех людей – Восточная Африка: оттуда волнами выходили всё более совершенные представители рода «Хомо», разбредавшиеся по всему свету. Люди современного анатомического облика (Хомо сапиенс сапиенс) вышли с африканского континента около 60 000 лет назад и на просторах Евразии скрещивались со своими предшественниками, в том числе с денисовцами (названы по Денисовой пещере на Алтае). Следы жтой гибридизации присутствуют в геномах современных людей: от 4% до 6% ДНК аборигенов Новой Гвинеи и Соломоновых островов составляет ДНК денисовцев, у уроженцев материковой Азии и индейцев Америки доля такой ДНК оценивается …

«Бутылочным горлышком» называют периоды максимального сокращения популяции человеческих предков. Таких периодов в процессе эволюции было несколько. Портал МИР 24 со ссылкой на журнал Science сообщает, что исследователи из Техасского научного центра здравоохранения, используя новую модель определения численности вида в прошлом на базе более чем трёх тысяч геномов человека, обнаружили самое раннее «бутылочное горлышко», через которое предки современных людей прошли приблизительно между 930 и 813 тысячами лет назад. По данным исследования, в то время в процессе размножения участвовали всего около 1280 особей рода Хомо. Это «бутылочное горлышко» продолжалось около 117 тысяч лет. Становится понятным, почему на этот период падает существенный хронологический …

Палеогенетики секвенировали ДНК из останков 32 представителей Срубно-алакульской культурной традиции ((XVIII-XII вв. до Р.Х.) из кургана эпохи поздней бронзы,  расположенного на территории Челябинской области. Исследование обнаружило родственные связи между захороненными людьми, что позволило построить генеалогическое древо из трёх поколений. Также подтверждено происхождение срубников от носителей более ранней Синташтинской культуры бронзового века (конец III – начало II тыс. до Р.Х.).

. Результаты исследования, поддержанного грантом Российского научного фонда, опубликованы в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

См.: https://poisknews.ru/themes/arheologiya/paleontologiya/genealogicheskoe-drevo-yuzhnyh-uralczev-iz-kurgana-bronzovogo-veka-postroili-paleogenetiki/

         Опубликованы новые данные о результатах археологического, антропологического и палеогенетического исследования неолитического могильника в городище Гюржи-ле-Нуаза (Gurgy ‘les Noisats’) в коммуне Гюржи в 150 км к юго-востоку от Парижа, в департаменте Йонна (Yonne), регион Бургундия – Франш-Конте. Некрополь в Гюржи относится к сернийской культуре, переходной к среднему неолиту.

Были исследованы захоронения и геномы останков   128 человек, из которых 94 оказались представителями семи поколений одной семьи. Мужчины этой семьи брали жён из соседних родовых групп, а взрослые дочери покидали семейную группу и уходили в группу своего партнера. Все члены семьи соблюдали строгую моногамию, сводных братьев и сестёр среди них нет.

Захоронения …

О том,/ что несколько процентов нашего генома содержат ДНК неандертальцев и «денисовского человека», известно уже довольно давно. Новые исследования показали, что среди наших предков есть и другие человеческие виды.

Портал «Читай и думай, Сызрань» сообщает, что «трио исследователей из США» разработало ARGweaver-D – усовершенствованную версию пакета прикладных программ ARGweaver, содержащего программы и библиотеки для выборки и управления графами наследственной рекомбинации (ARG); результатом его работы является представление происхождения последовательностей ДНК в геноме. Пользователь новой версии выбирает демографическую модель, включающую, например, сведения о расселении и миграциях нужных биологических видов; исходя из этих данных, компьютер анализирует геном и восстанавливает историю скрещиваний.

Американские учёные …

В России пиктов знают в основном по поэме Роберта Стивенсона «Вересковый эль» (в переводе С. Я. Маршака – «Верссковый мёд»): 

«Пришел король шотландский,

Безжалостный к врагам,

Погнал он бедных пиктов

К скалистым берегам».

Татуированные с головы до ног разбойники, которых Маршак почему-то назвал   «малютками-медоварами», обитали на северо-востоке современной Шотландии во времена позднего британского «железного века» и Раннего Средневековья. Ранее уже исследовались образцы тканей из пиктских захоронений в Балинторе (регион Истер Росс) и в Лундин Линксе (регион Файф), представляющих северную и южную части «Земли пиктов». У них определили обычные для современных северо-западных европейцев митохондриальные гаплогруппы H1c20, H2a1e, T2a1a, T2b11, J1c3b, J1c3b1, …

PCR News (информационно-аналитический портал о молекулярной диагностике) со ссылкой на журнал Nature излагает результаты исследования геномов народа суахили, которое провела команда генетиков Гарвардского университета, Университета Южной Флориды, Университета Райса в Хьюстоне, Университета Йорка (Канада), Университета науки и технологий (Кения) и других научных организаций США, Канады и некоторых стран Африки.

Суахили – африканский народ, говорящий на языке группы банту – сегодня проживает в Танзании, Кении, на севере Мозамбика, на юге Сомали, на Мадагаскаре и на нескольких архипелагах Индийского океана.

На африканском побережье Индийского океана сохранились руины многочисленных средневековых городов суахили. Специалисты выделили 54 генома индивидов, найденных в их захоронениях на территории …

Портал «N+1: научные статьи, новости, открытия» со ссылкой на сервер  препринтов по биологии bioRxiv излагает содержание статьи Hannah Moots et al.

Группа ученых из Австрии, Алжира, Италии, Нидерландов, США и Туниса под руководством Рона Пинхаси (Ron Pinhasi) прочитала 30 геномов, относящихся к железному веку (он начался примерно в 1200-800  гг. до н. э.). Все геномы принадлежат жителям Центрального Средиземноморья – Туниса (12), Сардинии (3) и Центральной Италии (15). Кроме того, были привлечены ранее опубликованные данные по 9 жителям Сардинии 818–208 гг. до н. э. и по 11 жителям Италии 963–200 гг. до н. э.

Территория, на которой проживали обладатели изученных …

Портал N + 1 (научно-популярное развлекательное издание) излагает содержание статьи Zoltan Maroti et al. в «Current Biology». Статья посвящёна генетическому исследованию происхождения гуннов, аваров и венгров, последовательно казавшихся в Карпатском бассейне в V–IX веках от Р. Х. – в эпоху Великого переселения народов.

Результаты секвенирования 271 генома подтвердили правильность гипотезы о преемственности между родственными ханьцам (китайцам) азиатскими хунну и европейскими гуннами, а также происхождение аваров с территории современной Монголии.

Сегодняшние венгры являются потомками хунну, которые, как и предполагали историки,  двигались на запад от границ Китая, подчиняя и увлекая за собой гораздо более многочисленные азиатские и восточноевропейские племена.

Исследование показало, что …

Индейский народ олони населял тихоокеанское побережье нынешних Соединённых Штатов между заливами Сан-Франциско и Монтерей. Олони одразделялись на восемь субэтносов, говоривших на родственных языках. С приходом испанцев олони стали вымирать от неизвестных им ранее болезней – оспы, дифтерии и кори. Если до колонизации общая численность олони оценивалась в 30 тысяч человек, то к 1920-м годам их насчитывалось менее сотни. В 1925 году антрополог Альфред Крёбер из Калифорнийского университета в Беркли писал, что олони полностью исчезли. Однако некоторые олони не только выжили, но и сохранили национальное самосознание.

В США в настоящее время проживают около 5 миллионов индейцев. По данным за 2008 год …

Генетики Института Эли и Эдит Л. Брод (Broad Institute) uри Массачусетском технологическом институте и Гарвардском университете, изучив геномы 3600 древних и современных людей со всего света, представили наиболее полное генеалогическое древо вида Homo sapiens из когда-либо созданных.

Древнейшие предки всех людей жили на территории современного Судана более миллиона лет назад и относились к виду Homo erectus – предковому для Homo sapiens. Подтверждено также, что современные человеческие геномы за пределами Африки содержат гены вымерших человеческих видов – денисовцев и неандертьальцев.

Новые данные показывают, что наиболее значительные мутации Homo sapiens произошли примерно 72 000 лет назад и что наш вид населял Океанию …

Журнал Nature опубликовал результаты крупнейшего на сегодня исследования ядерной ДНК жителей Великобритании бронзового и железного века.

224 ученых из 15 стран под руководством Дэвида Райха (David Reich) из Гарвардского университета секвенировали ядерную ДНК 416 индивидов из Великобритании, увеличив таким образом общее количество изученнных геномов доримской эпохи до 598. При этом количество прочитанных геномов, относящихся к раннему бронзовому и железному векам, выросло с 13 до 365. Для сравнения с британскими были взяты около 400 геномов древних жителей Центральной и Западной Европы от Словакии ло Испании.

Исследование выявило наличие масштабной миграции в Британию ранее неизвестной популяции, жившей, вероятно, на территории Франции. Она …

По солобщению информационного портала «octagon» (Хабаровск), в стратегию развития Арктической зоны РФ и обеспечения национальной безопасности на период до 2035 года включён проект создания Всемирного центра мамонта. Его задача – повысить биоразнообразие планеты путём возвращения в природу вымерших биологических видов и усложнения структуры экосистем.

Между тем Всемирный центр мамонта, который ещё только планируется создать в Якутии, уже объявил, что собирается работать «над запуском клонирования клетки с ДНК мамонта». Екатерина Кузьмина, генеральный директор и единственный учредитель Фонда поддержки и сохранения природного и культурного наследия «Эффект мамонта» (адрес фонда: г. Москва, Первомайское поселение, квартал 365, д. 3) высказала мнение, что «пригодный для …

Медиаплатформа СМОТРИМ.РУ со ссылкой на Science Advances – издание Американской Ассоциации за научный прогресс (American Association for the Advancement of Science's) уверяет, что раскрыта тайна происхождения этрусков – предшественников римской цивилизации.

Язык этрусков до сих пор не расшифрован, и большая часть сведений о них почерпнута из сочинений римских авторов. Уже много столетий историки спорят о том, являются ли этруски коренными жителями Италии или пришельцами из других регионов. Как теперь выясняется, подобные споры довольно бессмысленны, поскольку абсолютно все народы Европы являются результатом смешения различных пришельцев. Вопрос только в том, кто, когда, откуда и каким путём пришёл.

 «В ходе новой работы, – …

Ранее по данным митохондриальной ДНК было установлено, что генетическое разделение собак и волков произошло от 36,9 до 41,5 тыс. лет назад. А около 17,5-23,9 тыс. лет назад уже частично одомашненные собаки разделились  на две ветви, одна из которых дала начало собакам Восточной Азии, а другая — собакам Европы, Африки, Западной Азии и Южной Азии.

Сейчас журнал Proceedings of the National Academy of Sciences опубликовал результаты исследования, согласно которым одомашнивание собак началось в условиях ледникового периода около 23 тысяч лет назад в Сибири, большая часть которой была чрезвычайно холодной и засушливой. Все потомки тех древних собак имели гаплогруппу А2b.

Последней территорией …

Согласно историческим преданиям, предки венгров (мадьяр) родственны башкирам. В IX веке их вождь Арпад, сын Алмоша, воевал на стороне Византии на Дунае против булгар (болгар), пришедших с Поволжья двумя столетиями раньше. Вернуться в родные степи мадьярам помешали печенеги, и Алмош расселил их в Паннонии, запустевшей из-за многочисленных нашествий. Так возникла Венгрия.

Сейчас эти предания нашли по крайней мере частичное подтверждение в результатах работы международной исследовательской группы, включавшей представителей Южно-Уральского государственного университета (Челябинск). Сравнив останки из захоронений древних венгров с 22 образцами из могильника Уелги в Кунашакском районе Челябинской области, генетики обнаружили большое сходство в их гаплотипах (разновидностях одного и того …

Собаки – самый древний и самый близкий животный партнёр человека. В Италии найдены кости собак, живших в пещерах вместе с людьми 20 тысяч лет назад. Остальные домашние животные, в том числе кошки, были приручены, когда люди перешли к оседлой жизни и занялись сельским хозяйством, то есть 6-8 тысяч лет назад.

В XIII веке писатель, поэт и чиновник Ли Кюбо (обратите внимание – корейский!) обращался к своему псу Пан-о с такими словами: «Хотя и животное низкого ранга, ты тот, кто опирается на духа Большой Медведицы. Обладаешь такой душой, да ещё и умом, кто из животных сравнится с тобой?».

Недавние исследования установили, …

Шотландские учёные провели ДНК-анализ останков из могилы так называемого «шестиглавого вождя». Это захоронение было обнаружено в 1997 году в маленькой рыбацкой деревушке Портмахомак (регион Истер Росс, Шотландия). Внутри находился один скелет, окруженный пятью черепами. Позднее нашли ещё один полный скелет, который археологи с первого взгляда не заметили.

Исследования показали, что останки датируются концом XIII – началом XV веков. Для Шотландии тех времён хоронить головы отдельно от тел было делом почти неслыханным. Старший из похороненных, убитый ударом меча, был очень высоким по тем временам – его рост составлял 175 см; он был погребён в церкви, что указывает на его принадлежность к …